Carlos José Ferreira da Silva

Carlos José Ferreira da Silva

Biólogo

São João de Meriti, RJ

Técnico em Enfermagem (2008), Bacharel em Ciências Biológicas com ênfase em Biotecnologia (UEZO, 2018), Mestre e atualmente Doutorando em Ciências Biomédicas pelo Programa de Pós-graduação em Biomedicina Translacional (BIOTRANS), cooperação entre UERJ, INMETRO e UNIGRANRIO. Atuação abrangente nas áreas de clínica, epidemiologia e bioestatística, com expertise no uso da linguagem de programação R para análise de dados. Experiência sólida em fisiologia humana e microbiologia, com foco na fisiopatologia da obesidade e suas comorbidades, incluindo diabetes mellitus tipo 2 e síndrome metabólica, além de sua interação com o microbioma humano. Forte conhecimento em biotecnologia de microrganismos aplicados à saúde. Proficiência em ferramentas de metagenômica, bioinformática e bioestatística, além de experiência em R, Git/GitHub e Apache Spark em R, com aplicação direta em pesquisa biomédica e clínica.

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Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Biomedicina Translacional

2021 - Atual

Universidade do Grande Rio
Eidy de Oliveira Santos. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Microbiota Oral; Diabetes Mellitus; Biomarcador; Metagenoma.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: METAGENÔMICA. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Mestrado em Biomedicina Translacional

2019 - 2021

Centro Universitário da Zona Oeste
Título: Estudo da correlação de fatores clínicos, demográficos e microbiológicos na Síndrome Metabólica em uma população residente no Rio de Janeiro, Ano de Obtenção: 2021
Eidy de Oliveira Santos.Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil. Palavras-chave: Metagenômica; Biomarcador; Síndrome Metabólica; Microbiota Oral.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: METAGENÔMICA.

Graduação em Ciências Biológicas

2014 - 2018

Centro Universitário da Zona Oeste
Título: Caracterização do Potencial de Bactérias Marinhas Brasileiras na Síntese de Antimicrobianos
Orientador: Eidy de Oliveira Santos
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.

Graduação interrompida em 2014 em Produção de Fármacos

2013 - Atual

Centro Universitário da Zona Oeste
Ano de interrupção: 2014

Ensino Médio (2º grau)

2006 - 2008

Escola Ligia Barreto Ltda

Formação complementar

2024 - 2024

Introduction to Bioinformatics. (Carga horária: 10h). , OmicsLogic, OL, Índia.

2024 - 2024

Introdução às aulas de Bioinformática. (Carga horária: 2h). , OmicsLogic, OL, Índia.

2023 - 2023

Análise de Dados. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2023 - 2023

Algoritimos e Modelos de Programação para Big Data. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2023 - 2023

Deep Learning. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2022 - 2022

Introdução à aprendizagem de máquina para Bioinformática. (Carga horária: 3h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2022 - 2022

Introdução à programação em R para manipulação e visualização de dados. (Carga horária: 12h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2022 - 2022

Linguagem R: do zero absoluto ao dominio em 7 horas. (Carga horária: 7h). , Udemy, UDEMY, Brasil.

2021 - 2021

Extensão universitária em Introdução ao software R. (Carga horária: 12h). , Experimental Analytics Corporation, EAC, Brasil.

2016 - 2016

introdução à Fotografia Cientifica Ambiental. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2015 - 2015

Extensão universitária em Estudo de Genomas. (Carga horária: 7h). , Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.

2015 - 2015

Extensão universitária em Metagenômica. (Carga horária: 8h). , Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.

2015 - 2015

Microbiologia tecnológica. (Carga horária: 4h). , Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.

2014 - 2014

Extensão universitária em Bioprospecção de Bactérias do Solo. (Carga horária: 4h). , Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.

2013 - 2013

Teste de dissolução do controle de qualidade da indústria farmacêutica. (Carga horária: 6h). , Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: METAGENÔMICA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia Ambiental e Recursos Naturais/Especialidade: Bioprospecção.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia em Saúde Humana e Animal/Especialidade: Novas Drogas Terapêuticas.

Organização de eventos

SILVA, C. J. F. ; PÁDUA, V. L. M. ; SILVA, C. V. F. ; VICTÓRIO, C. P. ; COSTA, D. S. . VIII Jornada de Ciência & Tecnologia da UEZO. 2015. (Outro).

SILVA, C. J. F. ; PEREIRA, R. F. P. ; PÁDUA, V. L. M. . II Simpósio de Biotecnologia e Biodiversidade da UEZO. 2014. (Outro).

Participação em eventos

II Escola Latino-Americana de Bioinformática para as Ciência Ômicas. 2024. (Simpósio).

Jornada em Ciência de Dados do LNCC. 2023. (Simpósio).

18ª Semana Nacional de Ciências e Tecnologia na Zona Oeste. Microbiota Humana: amiga ou inimiga?. 2021. (Exposição).

15ª Semana Nacional de Ciência e Tecnologia na Zona Oeste.Do ambiente para sociedade: Descobrindo os antimicrobianos. 2019. (Oficina).

15ª Semana Nacional de Ciência e Tecnologia na Zona Oeste.Alimentação saudável: uma maneira saborosa de utilizar alimentos probióticos. 2019. (Oficina).

I Simpósio de Virologia da Universidade Federal do Rio de Janeiro. 2017. (Simpósio).

Simpósio Internacional - Câncer: Avanços Recentes. 2017. (Simpósio).

X Jornada de Ciência e Tecnologia da UEZO: Desenvolvimento Socioambiental.Bioprospecção e caracterização do potencial biotecnológico das bactérias marinhas brasileiras na síntese de antimicrobianos. 2017. (Simpósio).

IX Jornada de Ciência & Tecnologia da UEZO.Bioprospecção de Bactérias Marinhas para Detecção de Antimicrobianos. 2016. (Seminário).

XX BioSemana UFRJ. 2016. (Simpósio).

I Simpósio de Ciência e Tecnologia Ambiental do Rio de Janeiro. 2015. (Simpósio).

Semana Nacional de Ciência e Tecnologia. A Biologia Molecular de "Jurassic Park". 2015. (Exposição).

II Simpósio de Biotecnologia e Biodiversidade do Centro Universitário Estadual da Zona Oeste ? UEZO. 2014. (Simpósio).

3ª Jornada de Ciências Farmacêuticas. 2013. (Outra).

Participação em bancas

Aluno: Isabella Brum de Mattos Magalhães Pereira

DA SILVA, C. J. F.; FERREIRA, R. P.; BERBERT, L. C.. AVALIAÇÃO DA INTER-INFLUÊNCIA DOS QUADROS CLÍNICOS DE DIABETES MELLITUS TIPOS 2 E PRÉ-DIABETES COM A MICROBIOTA ORAL HUMANA. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro.

Orientou

Isabella Brum de Mattos Magalhães Pereira

AVALIAÇÃO DA INTER-INFLUÊNCIA DOS QUADROS CLÍNICOS DE DIABETES MELLITUS TIPOS 2 E PRÉ-DIABETES COM A MICROBIOTA ORAL HUMANA; Início: 2020; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário da Zona Oeste; (Orientador);

Pedro Henrique Britto dos Santos

Bioprospecção das bactérias marinhas da baia de Sepetiba na síntese de antimicrobianos; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Centro Universitário da Zona Oeste, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ; (Orientador);

Isabella Brum de Mattos Magalhães Pereira

AVALIAÇÃO DA INTER-INFLUÊNCIA DOS QUADROS CLÍNICOS DE DIABETES MELLITUS TIPOS 2 E PRÉ-DIABETES COM A MICROBIOTA ORAL HUMANA; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário da Zona Oeste; Orientador: Carlos José Ferreira da Silva;

Produções bibliográficas

  • Silva, Carlos José Ferreira da ; SILVA, CARLOS VINICIUS FERREIRA DA ; CARDOSO, ALEXANDER MACHADO ; DE OLIVEIRA SANTOS, EIDY . Exploring clinical parameters and salivary microbiome profiles associated with metabolic syndrome in a population of Rio de Janeiro, Brazil. ARCHIVES OF ORAL BIOLOGY , v. 175, p. 106251, 2025.

  • FERREIRA DA SILVA, CARLOS VINICIUS ; Da silva, Carlos José Ferreira ; BACILA SADE, YOUSSEF ; NARESSI SCAPIN, SANDRA MARA ; THOMPSON, FABIANO L. ; THOMPSON, CRISTIANE ; DA SILVA'BOGHOSSIAN, CARINA MACIEL ; DE OLIVEIRA SANTOS, EIDY . Prospecting Specific Protein Patterns for High Body Mass Index (BMI), Metabolic Syndrome and Type 2 Diabetes in Saliva and Blood Plasma From a Brazilian Population. Proteomics Clinical Applications , v. e20230, p. 1, 2024.

  • FRÓES, ADRIANA M. ; FREITAS, THAMYRES C. ; VIDAL, LIVIA ; APPOLINARIO, LUCIANA R. ; LEOMIL, LUCIANA ; VENAS, TAINÁ ; CAMPEÃO, MARIANA E. ; SILVA, CARLOS J. F. ; MOREIRA, ANA PAULA B. ; BERLINCK, ROBERTO G. S. ; THOMPSON, FABIANO L. ; THOMPSON, CRISTIANE C. . Genomic Attributes of Novel Symbiont Pseudovibrio brasiliensis sp. nov. Isolated From the Sponge Arenosclera brasiliensis. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE , v. 5, p. 1-10, 2018.

  • DA SILVA, C. J. F. ; SILVA, C. V. F. ; SANTOS, E. O. . Biotecnologia marinha. In: Marcelo Musci; Gisele Antolin. (Org.). SETOR NAVAL SUAS TECNOLOGIAS E O MEIO AMBIENTE. 1ed.Curitiba: EDITORA CRV, 2023, v. 6, p. 105-125.

  • SILVA, C. J. F. ; SANTOS, E. O. ; MOREIRA, A. P. B. . Bioprospecção e caracterização do potencial biotecnológico das bactérias marinhas brasileiras na síntese de antimicrobianos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • SILVA, C. J. F. ; SANTOS, E. O. ; MOREIRA, A. P. B. . Bioprospecção de Bactérias Marinhas para Detecção de Antimicrobianos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • DA SILVA, C. J. F. ; MARINHO, F. S. . Introdução a bioestatística: Linguagem de Programação em R. 2024. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

  • DA SILVA, C. J. F. . Ferramentas estatísticas SPSS e MetaboAnalyst aplicadas a dados biomédicos?. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

  • 2021 - Atual

    Estudo do microbioma humano para prospecção de biomarcadores da obesidade e diabetes mellitus do tipo 2, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eidy de Oliveira Santos em 25/11/2024., Descrição: Analisar a microbiota dos principais sítios do corpo humano e suas possíveis relações com a obesidade e sua comorbidades, como as desordens metabólicas, hormonais, cardiovasculares e neurodegenerativas. Objetivando a busca de possíveis biomarcadores microbianos precoces destas desordens, auxiliando os diagnósticos clínicos já existentes, melhorando a qualidade de vida brasileira.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Carlos José Ferreira da Silva - Integrante / Eidy de Oliveira Santos - Coordenador / Carlos Vinicius Ferreira da Silva - Integrante / Débora Vitória da Silva de Oliveira - Integrante.

  • 2019 - Atual

    Estudo do microbioma humano para prospecção de biomarcadores da obesidade e Síndrome metabólica, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eidy de Oliveira Santos em 25/11/2024., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Carlos José Ferreira da Silva - Integrante / Eidy de Oliveira Santos - Coordenador / Carlos Vinicius Ferreira da Silva - Integrante / Débora Vitória da Silva de Oliveira - Integrante / Isabella Brum De Mattos Magalhães Pereira - Integrante.

  • 2016 - 2018

    Caracterização do Potencial de Bactérias Marinhas Brasileiras na Síntese de Antimicrobianos, Descrição: O ambiente marinho é o maior habitat da Terra, representando aproximadamente 70% da superfície do planeta. Apesar de abrigar cerca de metade da biodiversidade global, o ambiente marinho ainda é pouco explorado para propósitos biotecnológicos. O empenho científico em descobrir o potencial biotecnológico e econômico da biodiversidade marinha brasileira é crescente e se ampliou ainda mais com a delimitação da Amazônia Azul. Bactérias do gênero Vibrio são abundantes e dispersas no ambiente marinho, sendo capazes de se associar com invertebrados marinhos, ou de ser patógenos de humanos e organismos marinhos. A versatilidade metabólica, a variedade de sistemas de sinalização celular e a alta flexibilidade genômica conferem a estas bactérias um alto potencial biotecnológico. Já foram descritos alguns metabólitos secundários bioativos como antimicrobianos e hidrolases produzidos por vibrios, muitos em fase de teste para utilização na bioindústria. No Brasil, estudos pioneiros sobre diversidade bacteriana descreveram a diversidade cultivável de bactérias heterotróficas em corais saudáveis e doentes do Banco de Abrolhos onde foi observada grande diversidade de vibrios, incluindo patógenos conhecidos. A diversidade bacteriana cultivável de holobiontes marinhos no Arquipélago de São Pedro e São Paulo (ASPSP) também foi descrita e os vibrios igualmente se sobressaíram. Destes e outros trabalhos resultou uma coleção de mais de 800 isolados bacterianos, sendo majoritários os gêneros Vibrio e Pseudovibrio. Membros deste grupo já foram reconhecidos pelas atividades lipolítica e antimicrobiana. No presente estudo foi realizado o rastreamento da atividade antibacteriana das bactérias marinhas da coleção do ASPSP (de corais escleractíneos e de verme-de-fogo), de savelhas (Brevoortia aurea) da Baía de Guanabara, de baiacus (Tetraodontidae) de Arraial do Cabo (RJ), e da esponja Arenosclera brasiliensis (Búzios, RJ). Para verificar se a substância ativa das amostras positivas é de natureza proteica foram realizados ensaios com proteases. As bactérias indicadoras utilizadas foram Burkholderia cenocepacia ET12 amostra J2315, causadora de infecções pulmonares em pacientes imunodeprimidos; V. coralliilyticus P1, patógeno de corais, e V. parahaemolyticus da coleção Manguinhos portador de hemolisinas (tlh e trh). Foram detectados oitenta e dois isolados positivos dentre os quinhentos testados, sendo 80 do ASPSP. Dois isolados, A-70 e A-78, do ASPSP, foram capazes de impedir o crescimento das três linhagens indicadoras. Foi detectada a inibição da antibiose por proteases em sete casos de 40 isolados testados oriundos do ASPSP. O potencial biotecnológico das bactérias marinhas do ASPSP é promissor em relação ao fornecimento de substâncias antibióticas de interesse biomédico.Palavras-chave: Bioprospecção, Biotecnologia, Vibrio, Pseudovibrio, Arquipélago de São Pedro e São Paulo. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Carlos José Ferreira da Silva - Integrante / Eidy de Oliveira Santos - Coordenador / Ana Paula Barbosa Moreira - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Bolsa.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade do Grande Rio, Laboratório de Genética. , Avenida Perimetral Professor José de Souza Herdy - de 534 ao fim - lado par, Jardim Vinte e Cinco de Agosto, 25071202 - Duque de Caxias, RJ - Brasil, Telefone: (21) 32194040

Experiência profissional

2018 - 2018

Centro Universitário da Zona Oeste

Vínculo: Programa de Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor de Biologia Molecular, Carga horária: 10

2016 - 2018

Centro Universitário da Zona Oeste

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Iniciação Cientifica, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 04/2016

    Pesquisa e desenvolvimento, CCBS.Linhas de pesquisa

2021 - Atual

Universidade do Estado do Rio de Janeiro

Vínculo: Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 20

2019 - 2021

Universidade do Estado do Rio de Janeiro

Vínculo: Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 20

Atividades

  • 03/2019

    Pesquisa e desenvolvimento, Centro Biomédico, Faculdade de Ciências Biológicas e Saúde.Linhas de pesquisa